在大多数5岁以下儿童中，感染并无症状。在青少年和成人中，它可能会或不会引起传染性单核细胞增多症。
从受感染到出现症状的时间通常认为是30～50天。这个时期被称为潜伏期。
E-B 病毒传染性单核细胞增多症的 4 个主要症状是
极度疲乏
发热
喉咙痛
淋巴结肿大
累及喉的传染性单核细胞增多症图片 P. MARAZZI 博士／科学图片库
但并非每例病人都具有这 4 大症状。通常情况下，感染首先是全身感觉不适（不舒服）和低热，随后是咽喉痛和／或淋巴结肿大。疲劳通常是严重的，在最初2～3周内通常最严重，但可能持续数月。发烧通常在下午或傍晚时升至最高峰，约达 39.5°C（约 103°F）。咽喉往往非常疼痛，咽后壁可出现脓样物质。淋巴结肿大可发生在任何部位，最常见的是颈部淋巴结肿大。在某些患者中，唯一的症状是淋巴结肿大（有时被误认为“腺体肿胀”）。
传染性单核细胞增多症引起的皮疹图片 MID ESSEX HOSPITAL SERVICES NHS TRUST/科学图片库
50％以上的传染性单核细胞增多症患者出现脾脏肿大。对于大多数感染者，肿大的脾脏不会引起任何症状，但在受外伤时可能发生脾破裂。脾破裂可危及生命。肝脏也可轻度肿大。有时眼周区域肿胀。
皮疹并不常见。然而，服用抗生素氨苄青霉素的 E-B病毒感染者可能更容易出皮疹。
其他很少见的并发症包括癫痫发作、神经损害、行为异常和脑部炎症（脑炎）或覆盖脑部的组织炎症（脑膜炎）、贫血和由淋巴结肿大引起的气道阻塞。
病程长短不一。大约2周后症状缓解，此后大多数人可恢复正常生活。然而疲乏症状可持续数周，有时甚至数月。不到 1% 的患者会死亡，通常是因为脑炎、脾破裂或气道堵塞等并发症。